Zrušení registrace plátce

Novelou zákona č. 235/2004 Sb., o dani z přidané hodnoty, ve znění p.p., která byla provedena zákonem č. 461/2024 Sb., byla s účinností od 1. 1. 2025 v návaznosti na pravidla stanovená ve směrnici 2006/112/ES o společném systému daně z přidané hodnoty upravena pravidla pro registraci osoby povinné k dani jako plátce.

V návaznosti na to byla upravena také pravidla pro zrušení registrace plátce, která vyplývají od 1. 1. 2025 z § 106 zákona o DPH. V tomto paragrafu jsou upraveny podmínky jak pro zrušení registrace plátce z moci úřední, tak i podmínky pro zrušení registrace na žádost plátce. Tato pravidla se pro rok 2026 nezměnila. V následujícím článku jsou nejprve stručně vysvětlena základní pravidla pro zrušení registrace plátce při zanechání ekonomické činnosti, dále pravidla pro zrušení registrace z mocí úřední a návazně s využitím příkladů novelizovaná pravidla pro zrušení registrace plátce na jeho žádost. V závěru článku jsou stručně shrnuta aktuálně platná základní pravidla pro snížení nároku na odpočet daně při zrušení registrace plátce.

Zrušení registrace plátce při
zanechání ekonomické činnosti

Pravidla pro zrušení registrace plátce z moci úřední, tj. na základě rozhodnutí správce daně jsou upravena v § 106 odst. 1 až 3 zákona o DPH. Podle § 106 odst. 1 zákona o DPH zruší správce daně registraci plátce, a to jak na základě vlastního rozhodnutí, tak i na žádost plátce v případě, že plátce přestal uskutečňovat ekonomickou činnost v tuzemsku. Z tohoto odstavce tedy vyplývá zrušení registrace jak z moci úřední, tak na žádost plátce v případě, že plátce přestal uskutečňovat ekonomickou činnost v tuzemsku a zároveň daný plátce není v tuzemsku registrován k dani ve zvláštním režimu jednoho správního místa. Vzhledem k tomu, že se podle tohoto odstavce musí jednat o ekonomickou činnost v tuzemsku, není pro zrušení registrace plátce z tohoto důvodu podstatné, zda plátce uskutečňuje ekonomickou činnost v jiném členském státě.

Na tento odstavec navazuje § 6 odst. 4 zákona o DPH, podle něhož osoba povinná k dani se sídlem v tuzemsku, které byla zrušena registrace podle § 106 odst. 1 zákona o DPH, tj. z důvodu, že jako plátce přestala uskutečňovat ekonomickou činnost, se stane plátcem ode dne, ve kterém uskutečnila plnění, u kterého by měla nárok na odpočet daně, pokud by byla plátcem, a to v případě, že v příslušném nebo bezprostředně předcházejícím kalendářním roce její obrat v tuzemsku překročil částku 2 000 000 Kč jako limit stanovený v § 6 odst. 1 zákona o DPH pro povinnou registraci osoby povinné k dani jako plátce daně. Tato právní úprava je odůvodňována předpisy EU, z nichž vyplývá povinnost zůstat registrován v systému DPH minimálně jeden rok.

Pokud je však plátcem ukončena ekonomická činnost, umožňuje zákon o DPH, jak vyplývá z § 106 odst. 1 zákona DPH, zrušit výjimečně registraci plátce dříve než po jednom roce. Z § 6 odst. 4 zákona o DPH vyplývá, že začne-li osoba, které byla podle § 106 odst. 1 zákona o DPH zrušena registrace, ve stejném roce, kdy ji byla zrušena registrace, znovu uskutečňovat ekonomickou činnost, nestává se plátcem od následujícího dne po překročení obratu, ale je plátcem okamžitě dnem uskutečnění zdanitelného plnění, jak je vysvětleno v následujícím příkladu.

Příklad 1

Opětovná registrace po zrušení registrace plátce v roce 2026

Fyzická osoba, která je plátcem, požádala v lednu 20265 o zrušení registrace plátce s odůvodněním, že ve smyslu § 106 odst. 1 zákona o DPH přestala uskutečňovat ekonomickou činnost v tuzemsku. Obrat v tuzemsku tohoto plátce za rok 2025 překročil částku 2 000 000 Kč. 

Pokud by po zrušení registrace uskutečnila tato osoba 22. 2. 2026 zdanitelné plnění v tuzemsku, u kterého by měla nárok na odpočet daně, stala by se znovu plátcem, a to okamžitě od 22. 2. 2026, tj. dnem uskutečnění tohoto zdanitelného plnění, z něhož by jí jako plátci vznikla povinnost přiznat daň. Podle § 94 odst. 3 zákona o DPH má povinnost podat přihlášku k registraci do 10 pracovních dnů od uskutečnění tohoto zdanitelného plnění.

Zrušení registrace z moci úřední

Podle § 106 odst. 2 zákona o DPH zruší správce daně registraci plátce z moci úřední, pokud za předcházející kalendářní rok, po který byl plátcem, neuskutečnil plnění, které spadá do obratu v tuzemsku, a takové plnění neuskutečnil také do dne předcházejícího dni zahájení řízení o zrušení registrace.

Ke zrušení registrace podle tohoto odstavce tedy musí být splněny 2 podmínky:

1)  plátce za předchozí kalendářní rok neuskutečnil plnění, které spadá mezi plnění, která se počítají do obratu v tuzemsku

2)  zároveň takové plnění neuskutečnil v roce, kdy správce daně zahájil řízení o zrušení registrace.

Je-li plátce v tuzemsku registrován v režimu EU nebo dovozním režimu zvláštního režimu jednoho správního místa (OSS), může mu správce daně zrušit registraci podle tohoto odstavce pouze v případě, že v předchozím kalendářním roce ani v roce, kdy zahájil řízení o zrušení registrace, neuskutečnil vybrané plnění, na které se vztahuje tento zvláštní režim.

Podle § 106 odst. 3 zákona o DPH zruší správce daně registraci plátce z moci úřední, pokud plátce závažným způsobem poruší své povinnosti vztahující se ke správě daně a jsou splněny další podmínky pro zrušení registrace.

Podle písmene a) tohoto odstavce zruší správce daně registraci plátci, který závažným způsobem poruší své povinnosti vztahující se ke správě daně. Jedná se podle bodu 1 o plátce, který nemá sídlo v tuzemsku, který se stal plátcem podle § 6c zákona o DPH a neuskutečnil za 3 bezprostředně předcházející po sobě jdoucí kalendářní měsíce žádné zdanitelné plnění. Podle bodu 2 se jedná o jiného plátce, než který nemá sídlo v tuzemsku, tj. prakticky o plátce se sídlem v tuzemsku, který se stal plátcem z důvodu překročení limitu obratu v tuzemsku pro povinnou registraci plátce ve výši 2 000 000 Kč. Podmínkou zrušení registrace podle tohoto písmene je že obrat v tuzemsku tohoto plátce za předchozí kalendářní rok nepřekročil částku 2 000 000 Kč. Podle bodu 3 tohoto písmene může správce daně zrušit i registraci skupiny, Pokud závažným způsobem poruší své povinnosti vztahující se ke správě daně

Podle písmene b) zruší správce registraci plátci, který se stal plátcem podle § 6c zákona o DPH, tj. osobě povinné k dani se sídlem v jiném členském státě, která nevyužívá režim pro malé podniky. Podmínkou je, že tento plátce neuskutečnil za 6 předcházejících kalendářních měsíců v tuzemsku zdanitelné plnění ani plnění osvobozené od daně s nárokem na odpočet daně.

Podle písmene c) zruší správce daně registraci plátce, který je osobou neusazenou v tuzemsku, pokud za 3 poslední měsíce uskutečňuje pouze vybraná plnění v rámci zvláštního režimu jednoho správního místa (OSS). Navazující podmínkou je, že mu zároveň nevznikla povinnost přiznat daň podle § 108 odst. 2 nebo 3 zákona o DPH, tj. z důvodu pořízení zboží z jiného členského státu nebo přijetí služby od osoby neusazené v tuzemsku.

Z písmene d) vyplývá zrušení registrace z moci úřední v případě plátce se sídlem v tuzemsku, který není skupinou, a který byl alespoň 1 kalendářní rok plátcem. Další podmínkou pro zrušení registrace, je že tento plátce uskutečnil za předchozí kalendářní rok a v příslušném kalendářním roce pouze plnění, u kterých neměl nárok na odpočet, tj. zejména plnění osvobozená od daně bez nároku na odpočet daně vymezená v § 51 zákona o DPH.

Zrušení registrace
na žádost plátce

Podmínky pro zrušení registrace na žádost plátce vyplývají z § 106 odst. 4 až 6 zákona o DPH. Podle odstavce 4 zruší správce daně registraci plátce na jeho žádost, pokud má tento plátce podle písmene a) sídlo v tuzemsku, není skupinou, uplynul minimálně jeden kalendářní rok ode dne, kdy se stal plátcem, a jeho obrat v tuzemsku nepřesáhl za předchozí kalendářní rok ani v příslušném kalendářním roce 2 000 000 Kč jako limit obratu pro povinnou registraci podle § 6 odst. 1, nebo uskutečnil za předchozí kalendářní rok a v příslušném kalendářním roce pouze plnění, u kterých neměl nárok na odpočet daně.

Příklad 2

Zrušení registrace na žádost plátce

Osoba povinná k dani se stala plátcem z důvodu překročení limitu obratu v roce 2024. V roce 2025 dosáhla obratu ve výši 1 800 000 Kč a od začátku roku 2026 do března tohoto roku, kdy žádá o zrušení registrace, dosáhla obratu v tuzemsku ve výši 350 000 Kč. 

Byla tedy registrováná jako plátce po celý kalendářní rok 2025 a její obrat v tuzemsku za rok 2025 ani za rok 2026 nepřekročil částku 2 000 000 Kč. Podmínky pro zrušení registrace na žádost tedy tento plátce splnil.

Podle § 106 odst. 4 písm. b) zákona o DPH zruší správce daně registraci plátce, který se stal plátem podle § 6c odst. 2 zákona o DPH, podle něhož se stane plátcem osoba neusazená v tuzemsku, která uskutečnila dodání zboží z tuzemska do jiného členského státu. Tento plátce může požádat o zrušení registrace, pokud za 2 bezprostředně předcházející po sobě jdoucí kalendářní měsíce v tuzemsku neuskutečnil zdanitelné plnění nebo dodání zboží do jiného členského státu osvobozené od daně s nárokem na odpočet daně, až na stanovené výjimky, např. vybrané plnění, na které se vztahuje zvláštní režim OSS.

Podle § 106 odst. 5 zákona o DPH zruší správce daně registraci plátce na jeho žádost, pokud nemá sídlo v tuzemsku, nestal se plátcem podle § 6c zákona o DPH, tj. např. překročil limit obratu v tuzemsku pro povinnou registraci plátce a splní stanovené podmínky, které jsou obdobně jako podmínky v předchozím odstavci 4. Navíc musí splnit podmínku, podle níž ke dni podání žádosti uplynul alespoň jeden rok ode den, kdy se stal plátcem.

Podle § 106 odst. 6 zákona o DPH zruší správce daně registraci plátce na jeho žádost, pokud se stal plátcem dobrovolně, tj. podle § 6f zákona o DPH a ke dni podání žádosti uplynulo alespoň 6 měsíců ode dne, kdy se stal plátcem. Další podmínkou je, že jeho obrat v tuzemsku za příslušný ani předchozí kalendářní rok nepřekročil 2 000 000 Kč, jako limit pro povinnou registraci podle § 6 odst. 1 zákona o DPH.

Příklad 3

Zrušení dobrovolné registrace na žádost plátce

Osoba povinná k dani se stala dobrovolně plátcem v červnu 2025, protože očekávala, že v průběhu roku 2025, překročí její obrat v tuzemsku limit pro povinnou registraci.

 Její očekávání z hlediska dosahovaného obratu v tuzemsku se však nenaplnila, a proto může např. v únoru 2025 požádat podle § 106 odst. 6 zákona o DPH o zrušení registrace plátce.

Společná procesní ustanovení
pro zrušení registrace plátce

a to jak z mocí úřední, tak i na žádost plátce, jsou stanovena v § 106 odst. 7 a 8 zákona o DPH. Podle § 106 odst. 7 zákona o DPH má případné odvolání proti rozhodnutí správce daně o zrušení registrace, a to zejména v případě zrušení registrace z moci úřední odkladný účinek. Prakticky to znamená, že odvolá-li se plátce proti tomuto rozhodnutí, rozhodnutí správce daně o zrušení registrace nabyde účinnosti, až poté, co nabyde účinnosti rozhodnutí o odvolání.

Podle § 106 odst. 8 zákona o DPH plátce přestává být plátcem dnem nabytí právní moci rozhodnutí, kterým je mu zrušena registrace z moci úřední, nebo dnem předcházejícím dni přechodu daňové povinnosti zůstavitele. Požádá-li plátce o zrušení registrace podle § 106 odst. 4 zákona o DPH, nemůže tedy v žádosti o zrušení registrace požadovat, aby mu byla registrace plátce zrušena k určitému dni. Plátce musí vyčkat na vydání a doručení rozhodnutí správce daně o zrušení registrace.

Snížení nároku na odpočet daně
při zrušení registrace

Základní povinností plátce v návaznosti na zrušení registrace plátce je snížení nároku na odpočet daně, které je upraveno v § 79a až § 79e zákona o DPH. Základní pravidla pro snížení nároku na odpočet při zrušení registrace plátce, která se novelou zákona o DPH s účinností od 1. 1. 2025 nezměnila, vyplývají z § 79a zákona o DPH. Podle § 79a odst. 1 zákona o DPH se tato povinnost týká majetku, který je ke dni zrušení registrace obchodním majetkem plátce a u něhož uplatnil odpočet daně.

Podle § 79a odst. 2 zákona o DPH se částka snížení nároku na odpočet daně u nedokončeného majetku, u úplat za zdanitelná plnění, která se do dne předcházejícího dni zrušení registrace neuskutečnila, a u zásob, určí ve výši původně uplatněného odpočtu daně. Pro výpočet částky snížení nároku na odpočet daně u dlouhodobého majetku se přiměřeně použije § 78d odst. 2 zákona o DPH, tj. postupuje se obdobně jako pří úpravě odpočtu daně v souvislosti s prodejem dlouhodobého majetku. Bude-li plátce rušit registraci např. v roce 2026 a k datu zrušení registrace bude mít v obchodním majetku automobil jako dlouhodobý majetek, který pořídil v roce 2023 a uplatnil při jeho pořízení nárok na odpočet daně, snížení odpočtu daně se bude týkat pouze 2/5 uplatněného odpočtu daně, které odpovídají dvěma rokům zbývajícím do konce pětileté lhůty pro úpravu odpočtu daně.

Podle § 79a odst. 3 zákona o DPH se za stanovených podmínek provádí snížení odpočtu daně u drobného majetku v užívání pořízeného v období zahrnujícím 11 kalendářních měsíců před zrušením registrace a kalendářní měsíc, v němž došlo ke zrušení registrace, a to za podmínky, že u něj byl uplatněn odpočet daně alespoň ve výši 2 100 Kč. Snížení odpočtu daně se provede o poměrnou část výše uplatněného odpočtu za období, po které daný majetek nebyl obchodním majetkem plátce. Plátci tak je zachován odpočet daně za období, v němž byl majetek v jeho obchodním majetku a mohl jej tak používat k uskutečňování ekonomických činností.

Podle § 79a odst. 4 zákona o DPH se povinnost snížení nároku na odpočet daně při zrušení registrace vztahuje na vyjmenované případy, kdy byl majetek nabyt bez daně specifickým způsobem. Jedná se o majetek nabytý na základě rozhodnutí o privatizaci, majetek nabytý při nabytí obchodního závodu, majetek, který je součástí jmění přecházejícího při přeměně obchodní korporace, majetek, který plátce nabyl jako dědic pokračující v uskutečňování ekonomických činností po zemřelém plátci.